Skip to Content

Диапазон изменчивости гена мтДНК COI у Chironominae и Orthocladiinae (Chironomidae, Diptera) как таксономический критерий рода, трибы и подсемейства

ID: 2016-09-4353-T-9356
Тезис
Саратовский государственный медицинский университет, кафедра общей биологии, фармакогнозии и ботаники, Саратов, Россия; Санкт-Петербургский государственный университет, биологический факультет, Санкт-Петербург, Россия; Институт биологии развития им. Н.И. Кольцова РАН, Москва, Россия

Были установлены диапазоны нуклеотидной и аминокислотной изменчивости штрихкодового гена COI у видов одного рода, одной и разных триб, разных подсемейств и определена перспективность их применения в качестве таксономического критерия на примере комаров-звонцов подсемейств Chironominae и Orthocladiinae (Chironomidae, Diptera).

Получены следующие диапазоны нуклеотидной изменчивости: от 4.0 до 18.3% между видами одного рода; от 11.4% до 19.6% (15.5%) между видами разных родов одной трибы; от 13.6% до 21.3% (17.0%) – между видами разных триб и от 15.9% между видами разных подсемейств.

Нами установлено, что уровень аминокислотной дивергенции лучше нуклеотидной отображает молекулярные границы рода и трибы. Если уровень аминокислотной дивергенции лежит в пределах от 0 до 1.7% (1.1%), то пара сравниваемых видов принадлежит одному роду; если - в пределах от 1.7 до 4.0%, то одной трибе (2.7%); если - в пределах от 4.6 до 6.3% (5.1%), то разным трибам; если – более 7.9% (9.1%), то разным подсемействам. Достоверность определения с использованием выявленных диапазонов составляет не менее 75%, в связи с чем, границы дивергенции по аминокислотной последовательности COI между видами комаров-звонцов можно использовать как таксономические критерии рода, трибы и подсемейства.

Полученные нами выводы позволяют заключить, что диапазоны изменчивости аминокислотной последовательности COI между видами комаров-звонцов можно использовать как таксономические критерии рода, трибы и подсемейства.

Ключевые слова

Chironomidae, COI, таксономический критерий, род, триба, подсемейство
0
Ваша оценка: Нет



Оптимальный хостинг для Drupal, Wordpress, Joomla, Битрикс и других CMS, быстрые и надежные сервера, круглосуточная техподдержка Яндекс.Метрика