Родился 4 июня 1923 года в семье простых рабочих людей. Отец – портной, мать – домохозяйка. В 1941 году окончил десятилетку. Через несколько месяцев началась война и Яков Исаакович добровольцем пошел на фронт. Воевал на Смоленском, Белорусском фронтах в составе инженерных войск в звании сержанта, занимал должность командира отделения. Из воспоминаний жены Якова Исааковича: «Много о войне не рассказывал - не любил. Говорил только, что было очень тяжело…». Демобилизовался из армии в 1946 году в звании старшего лейтенанта, награжденный двумя орденами «Красной звезды», к тому времени ему было 23 года. Якова Исааковича уговаривали остаться в армии и сделать карьеру военнослужащего, но он решил продолжить учиться.

Возник вопрос: куда поступать? В юридический или в медицинский? В итоге, любовь к медицине победила и в 1946 году Яков Исаакович поступает в Саратовское медицинское училище на специальность «зубоврачевание». В 1949 году заканчивает училище с отличным дипломом.

Полгода работал зубным врачом в г. Коксы, но в 1950 году пришла повестка. Так как Яков Исаакович был военнообязанным, его направили служить по специальности на Сахалин, в поселок Сокол, где стояла 29-я воздушно-десантная дивизия. За время работы дважды поступал в Челябинскую военно-медицинскую академию, но безуспешно. Т.к. в медицинские институты принимали только до 30 лет, Я.И. Черномордин демобилизуется из Армии и едет в Москву. Там он поступает в Московский стоматологический институт. По семейным обстоятельствам, закончив первый курс, переводится на второй курс Казанского медицинского университета на стоматологический факультет. Это был первый набор для обучения врачей стоматологов, вместе с ним учились М.З.Миргазизов и И.Г.Ямашев, в будущем известные ученые и профессора.

Помимо учебы, вечером он работал в поликлинике зубным техником. В 1956 г. закончил университет с красным дипломом. Направлен на работу в г. Нальчик, но Яков Исаакович попросился в свой родной город Саратов. Некоторое время работал в Энгельсе, но как только освободилось место был переведен в Саратов заведующим отделением в детскую стоматологическую поликлинику. Через 1,5 года стал её главным врачом, в этой должности проработал 37 лет, совмещая основную деятельность врача и организатора здравоохранения с преподаванием в медицинском училище.

На общественных началах работал главным стоматологом области. Яков Исаакович был активным поборником профилактической стоматологии, ему удалось организовать в саратовских образовательных учреждениях целую сеть стоматологических кабинетов с внедрением в их работу принципов плановой санации. В его жизни всё было для детей, для своей поликлиники. «Приходил первый, уходил последний», – так вспоминают о нём сотрудники поликлиники.

Скончался Яков Исаакович на 80-м году жизни от третьего инфаркта миокарда. Во дворе детской стоматологической поликлиники до сих пор растут высокие ели, посаженные самим Яковом Исаакович Черномординым, как память о нём.