С самого момента открытия явления избирательной окраски хромосом и до настоящего времени не ослабевает интерес к изучению природы и механизмов дифференциальной окраски. Одним из подходов к пониманию природы хромосомной сегментации является выявление связи между дифференциальной деконденсацией участков хромосом, возникающей в процессе их предварительной обработки, и структурно-функциональными особенностями организации интерфазных и метафазных хромосом. Важным условием неравномерного окрашивания метафазных хромосом является предварительная обработка хромосомных препаратов различными химическими реагентами (трипсин, мочевая кислота для получения G-окраски, сильная щелочь при C-окраске) и растворами солей при определенных pH и температурах, модифицирующими хромосомную структуру.

В результате проведенной нами предобработки политенных хромосом Chironomus plumosus растворами трипсина разной концентрации по длине хромосом исчезли тонкие диски и чередовались окрашенные и слабо окрашенные участки. Окрашенные участки хромосом соответствовали блокам близкорасположенных друг к другу крупных дисков. Районы хромосом, включающие пуффы и тонкие диски, оказались более чувствительны к действию трипсина, чем крупные и плотно упакованные диски, включая гетерохроматин. Наши данные подтверждают предположение о том, что плотность упаковки хроматина является, по крайней мере, одним из факторов, обусловливающих дифференциальное окрашивание метафазных хромосом, при этом G-диски соответствуют более упакованным участкам интерфазной хромосомы и могут быть центрами конденсации хромосом в митотическом цикле.